传统的控制方法往往采用双速风机进行有级控制。同时，在每个通风柜的风口装设风阀，通过改变风阀的开关角度对通风柜的系统进行控制。由于此种控制方式较为粗放，往往不能得到实验所要求的风量。同时，由于采用风阀的调节方式，使得系统消耗大量的能量在风阀上，也会造成能量的极大浪费。

通风柜风机的排风量到底取多少比较合适，既能够有效排除室内的空气污染，又能够不影响实验效果和节能。一般情况下，每个通风柜的迎面风速根据所使用的实验药品事先予以确定，这样每个通风柜的风量就可以事先确定。变频控制的策略则可根据所开启风柜的数量占系统总通风柜的百分比来确定，当所开的风柜少，则风机转速低，风机总风量小;当所开通风柜多时，则系统风机转速高，风机总风量大;当系统通风柜全部打开时，则系统风机全速运行，风量达到最大值。